Tuy nhiên, sự sụt giảm thu nhập của doanh nghiệp và cá nhân do dịch bệnh COVID-19 cũng khiến huy động tiền gửi kém thuận lợi. Lãi suất tiền gửi vì thế khó có thể giảm tương ứng với mức giảm của lãi suất cho vay. Trong hơn một tháng qua, mặt bằng lãi suất kỳ hạn từ 6 tháng đến một năm giảm khoảng 0,3-1%, chênh lệch lãi suất giữa các ngân hàng khoảng 2- 3%. Hiện tại, lãi suất tiền gửi ở mức 4,1 – 4,75%/năm với các kỳ hạn từ 1 tới dưới 6 tháng, 5,1 - 7%/năm các kỳ hạn 6 - dưới 12 tháng, 6,2 – 7,4%/năm ở các kỳ hạn 12– 13 tháng. So sánh mức lãi suất huy động của các ngân hàng cho thấy, khối ngân hàng quy mô nhỏ có mức huy động khá cao. Chẳng hạn, tại kỳ hạn 6 tháng, lãi suất của SCB là 8,3%/năm; Nam Á Bank là 8% còn VietABank là 8,1%; BacABank 7,5%; PVComBank 7,4%... Trong khi tại kỳ hạn 12 tháng, mức lãi suất của các ngân hàng này là 8,48%; 8,3%; 7,6%; 7,8%; 7,99%... Còn tại các ngân hàng lớn như BIDV, VCB, Vietinbank, Agribank, mức lãi suất cho kỳ hạn 6 tháng lần lượt là 5,1%; 4,9%; 5,1%; 5,1% và lãi suất huy động cho kỳ hạn 12 tháng là 6,8%; 6,5%; 6,8%; 6,8%... Như thế, có thể thấy có sự chênh lệch khá lớn về mức lãi suất huy động của các tổ chức tín dụng. Đối với các ngân hàng quy mô nhỏ, mức lãi suất như trên tuy cao cũng không dễ dàng huy động vì còn phụ thuộc vào nhiều yếu tố. Còn với 4 ngân hàng lớn, dù độ tín nhiệm cao, nhiều người dân tin tưởng nhưng cũng khó lòng giảm thêm nữa bởi xuống tới mức khá thấp.
Rõ ràng, đây là bài toán cân đối rất khó khăn với các ngân hàng thương mại trong thời điểm hiện nay. Mức lãi suất cho vay buộc phải giảm, kể cả các khoản vay cũ và vay mới nhưng đầu vào thì lại khó giảm theo mức tương ứng. Tuy nhiên, trong bối cảnh đại dịch COVID- 19 tác động tiêu cực đối với nền kinh tế thì buộc các ngân hàng phải tính toán đầu vào, đầu ra, giảm chi phí, giảm lợi nhuận để cùng doanh nghiệp vượt qua cơn “bĩ cực”, vì suy cho cùng, doanh nghiệp có tồn tại, phát triển thì ngân hàng mới kinh doanh hiệu quả.